為免當事人或第三人持有之營業秘密於審理程序遭他人知悉，商業法院採取「秘密保持命令」制度（商業事件審理法第55條至第59條、第76條至第77條），當事人或第三人就其持有之營業秘密，經釋明符合下列情形者，法院得依其聲請，對他造、當事人、程序代理人、輔佐人或其他訴訟關係人發秘密保持命令：

一、當事人書狀之內容，記載當事人或第三人之營業秘密，或已調查或應調查之證據，涉及當事人或第三人之營業秘密。

二、為避免因前款之營業秘密經開示，或供該訴訟進行以外之目的使用，有妨害該當事人或第三人基於該營業秘密之事業活動之虞，致有限制其開示或使用之必要。

       受秘密保持命令之人，就營業秘密，不得為實施訴訟以外之目的而使用之，或對未受秘密保持命令之人開示。如違反秘密保持命令，處3年以下有期徒刑、拘役或科或併科新臺幣10萬元以下罰金。